Luca Cardelli: Bridging Industry and Academia

Luca Cardelli

Luca Cardelli

CREDIT: Microsoft Corporation

Traditioneel was het voor wetenschappers moeilijk om van een langetermijnbaan in de industrie terug te keren naar de academische wereld of vice versa, maar dat kan veranderen. Vorige week kreeg een industriewetenschapper voor het eerst een Royal Society Research Professorship toegekend. Luca Cardelli van Microsoft Research blijft zijn industriële positie behouden terwijl hij 20% van zijn tijd doorbrengt aan de Universiteit van Oxford. "Dr. Cardelli s nieuwe dubbele aansluiting is een perfect voorbeeld van het soort flexibiliteit dat we moeten tonen aan wetenschappers die willen werken op het raakvlak van academische en industriële wetenschap, " de president van de Royal Society, Paul Nurse vermeld in de nieuwsaankondiging.

Cardelli werkt sinds 1997 bij Microsoft Research Cambridge; vandaag is hij hoofdonderzoeker in de groep Programming Principles and Tools. Oorspronkelijk uit Italië behaalde Cardelli een Ph.D. in computerwetenschappen aan de Universiteit van Edinburgh in 1982. Hij bracht meer dan 3 jaar door bij AT&T Bell Labs, waar hij werkte als lid van de technische staf. Dat werd gevolgd door 12 jaar als onderzoeker bij het voormalige Digital Equipment Corporation Systems Research Center. Hoewel zijn basis ligt in programmeertalen en gedistribueerde systemen, past Cardelli onlangs zijn vaardigheden en kennis toe op systeembiologie en moleculaire programmering. Science Careers sprak met Cardelli over hoe zijn carrière de kloof tussen computerwetenschap en biologie en nu tussen de industrie en de academische wereld kon overbruggen.

"Ik heb het geluk gehad in industriële onderzoekslaboratoria te zijn die altijd erg vooruitstrevend en open waren." Luca Cardelli

Interviewfragmenten zijn bewerkt voor beknoptheid en duidelijkheid.

Vraag: Waarom besloot je na je promotie een baan in de industrie te nemen?

LC: Nou, dat was Bell Labs, in de tijd dat het het belangrijkste industriële onderzoekslaboratorium in de Verenigde Staten en waarschijnlijk de wereld was, en dus was het een zeer interessante kans. Het was industrieel, maar het was eigenlijk puur onderzoek.

Ik heb ook gekeken naar academische banen, maar ik vond niets echt interessant voor mij. Het duurt lang om je te vestigen in de academische wereld, en je moet veel administratie doen, dus ik dacht dat het een goed idee zou zijn om een ​​baan in onderzoek te hebben zonder enige vorm van administratieve taken.

In het tweede jaar bij Bell Labs nam ik een positie aan als universitair docent aan de Universiteit van Pennsylvania, dus ik was daar 6 maanden lang een cursus aan het geven. Ik hou ervan om lezingen te geven, maar ik vond het vreselijk om ze voor te bereiden, dus ik voelde me meer op mijn gemak in een industriële onderzoeksomgeving.

Vraag: U werkt nu op het raakvlak van informatica en biologie. Wat bracht je in de biologie?

LC: Ik ben altijd geïnteresseerd geweest in biologie, maar ik had nooit gedacht dat ik het professioneel zou doen. Ik raakte per ongeluk betrokken, begin 2000. Op dat moment bestudeerde ik het begrip berekening in omgevingen die computeragenten bevatten en het begrip compartimenten en nestelen. Ik werd benaderd door een oude collega, Ehud Shapiro van het Weizmann Institute of Science, om te werken aan biologische modellering in cellulaire omgevingen. Cellen hebben veel compartimenten, die zijn genest en bevatten ook computationele middelen zoals eiwitten, enzovoort. Shapiro heeft me ertoe gebracht toezicht te houden op een biologie Ph.D. student genaamd Aviv Regev, die aan deze onderwerpen werkte, en toen begon ik biologieboeken te lezen en zo. Toen raakte ik echt verslaafd en daarom begon ik steeds meer te werken aan biologische modellering. Ik begon een aantal projecten met medewerkers, meestal in de biologie, in een poging computertechnieken toe te passen op biologische problemen.

Vraag: Welke projecten voert u momenteel uit?

LC: Ik heb eigenlijk twee belangrijke, lopende projecten. Eén is meer aan de kant van de systeembiologie en probeert natuurlijke mechanismen te reverse-engineeren om te proberen te begrijpen hoe ze werken, en dit gaat over de celcyclus. Een van de interessante dingen is dat het biologische basisnetwerk van genen en eiwitten die de celcyclus implementeren hetzelfde is in alle eukaryoten. Van gist tot ons, ze gebruiken verschillende eiwitten, verschillende componenten, maar de connectiviteit tussen deze componenten is altijd hetzelfde. Dus ik heb gewerkt aan het modelleren van dat vanuit een computationeel oogpunt, met vragen als: hoe praten ze met elkaar? Hoe werken ze snel en hoe berekenen ze wat er moet gebeuren?

Het tweede project gaat meer over de technische kant van zaken, en het zit in DNA-computing. Het idee is dat, als je iets op nanoschaal wilt bouwen, de beste manier is om een ​​soort programmatische controle op te zetten over hoe materie zichzelf regelt. De beste manier om dit te weten is door DNA te gebruiken, voornamelijk omdat het een reeks letters is en u de letters kunt programmeren, en ten tweede omdat er een industriële technologie is waarmee u DNA kunt lezen en schrijven. En dus kun je DNA als een bouwmateriaal zien en kun je materie op moleculaire schaal programmeren via DNA.

Vraag: Net zoals men Microsoft niet gemakkelijk associeert met biologie, associeert men industrieel onderzoek niet gemakkelijk met wetenschappelijke vrijheid. Hoe vrij bent u geweest om uw belangen na te streven?

LC: Ik denk dat het afhangt van waar je bent. Ik heb het geluk gehad in industriële onderzoekslaboratoria te zijn die altijd vooruitstrevend en open waren. Dergelijke plaatsen zijn vrij uniek. Het beste voorbeeld was Bell Labs, deze open onderzoeksomgeving waar iedereen in feite zijn eigen agenda stelde, natuurlijk in de context van computer- en telecommunicatie. Hetzelfde gebeurt nu bij Microsoft Research. Dus u werkt in een omgeving waar, ja, het is industrieel, en er is zeker een verwachting om op het einde industriële toepassingen te produceren. Maar we werken ook in een omgeving die zeer goed is verbonden met de academische wereld, en de verwachting is dat je op zoek bent naar nieuwe dingen die van invloed kunnen zijn op het industriële landschap of het academische landschap en deze proberen te verkennen. Onze output is dus ofwel publicaties of interne technologieoverdracht.

In het geval van biologie is dit iets anders voor een bedrijf als Microsoft dat geen duidelijke agenda heeft om biologie te doen, maar desondanks vertakt de informatica zich in veel andere wetenschappen, en dus vanuit een industrieel oogpunt van zie het is onze taak om erachter te komen hoe mensen die in wetenschappelijke gebieden werken, computationele hulpmiddelen kunnen gebruiken. Dus dit wordt nu ook onze agenda, en in feite hebben we hier bij Microsoft Research een programma voor wetenschappelijk computergebruik, dus we zijn betrokken bij biologie en ook bij ecologie, omdat we, om te begrijpen wat nodig is, we moet het echt proberen en zelf doen.

Vraag: Heb je ooit een pleidooi gehouden voor het nastreven van biologie?

LC: Nou, dit begon als een hobby en op een dag zei een van mijn vice-presidenten: "Oh, ik wist niet dat je op dat gebied publiceerde." Maar gelukkig keek hij rond in het bedrijf en vond andere mensen met dezelfde hobby, dus op dat moment hadden we een soort grassroots-groep die in bio-informatica werkte. Dus nu is het een combinatie van een grassroots-beweging van wetenschappers en een nieuwe strategische richting die van bovenaf wordt bepaald.

Vraag: Op welke manieren verwacht u dat de academische wereld anders is dan uw branche-ervaring?

LC: We hebben veel studenten bij Microsoft Research, maar ze komen allemaal voor een periode van 3 maanden. Het verschil is dus dat er in de academische wereld ook studenten zijn voor een langdurig project. Een ander verschil is financiering. Bij Microsoft hoeven we geen financiering aan te vragen; we beslissen wat we willen doen, en als we goed zijn, is er geen probleem. In de academische wereld zal ik het standaard aanvraagproces voor financiering moeten doorlopen. In het verleden heb ik me aangemeld als ondersteunende deelnemer aan verschillende Europese onderzoeksprojecten uit de academische wereld, maar ik heb het nog nooit gedaan als hoofdonderzoeker, dus dat wordt een nieuwe ervaring.

De sponsoring van de Royal Society is in eerste instantie voor één Ph.D. student, en natuurlijk hebben we veel programma's binnen Microsoft zoals Ph.D. sponsoring en postdoc sponsoring, dus waarschijnlijk zal ik van sommige van deze programma's kunnen profiteren, maar ze hebben hun eigen beoordelingsproces, dus het is niet automatisch.

Vraag: Op welke manieren verwachten jullie dat de twee werelden elkaar aanvullen?

LC: Omdat ik steeds meer in de richting van biologie bleef werken, werd het steeds kritischer om met medewerkers samen te werken. In de academische wereld is het gemakkelijker om mensen te vinden om mee te werken in gebieden waar je niet zoveel weet als in je eigen traditionele gebieden. Dus, voor 20 procent van de tijd zal ik in Oxford zijn met studenten, en voor de andere 80 procent zal ik hier nog steeds zijn met mijn vrije onderzoekstijd zonder verplichtingen, dus hopelijk zal ik het beste van beide werelden combineren.

Vraag: Hoe kunnen jonge wetenschappers beslissen of de academische wereld of de industrie geschikt is?

LC Ze moeten op basis van deze afweging kiezen tussen het hebben van deze geweldige bron van langdurige studenten die met je samenwerken, maar in wezen een onderzoeksmanager worden, of werken in een onderzoeksgroep met veel collega's in tegenstelling tot studenten. Het hangt af van de persoonlijkheid van mensen, wat ze willen doen en hoe ze het willen doen.

Vraag: Enig advies voor jonge wetenschappers die geïnteresseerd zijn in het werken op het kruispunt van biologie en informatica?

LC Interdisciplinaire programma's bestaan ​​op een aantal plaatsen, in bio-informatica en bio-engineering, die mensen proberen te onderwijzen in biologie en informatica, dus probeer ze te vinden. Woon ook conferenties en postacademische workshops bij als ze die kunnen vinden, en zoek in het algemeen naar adviseurs die op dit gebied werken.