Onreproduceerbaarheid Honden Nieuwe herprogrammeermethode

TOKYO Sinds januari hebben wetenschappers over de hele wereld zonder succes geprobeerd een verrassende stamcelbevinding te reproduceren die beweerde dat alleen het benadrukken van volwassen cellen ze zou kunnen veranderen in krachtige stamcellen die lijken op die in vroege embryo's. Nu heeft Science Insider geleerd dat sommige van de laboratoria die betrokken waren bij de productie van de twee artikelen die het werk beschrijven, niet hadden geprobeerd de techniek te reproduceren voordat de artikelen werden gepubliceerd. Slechts twee van de bij de kranten betrokken labs zeggen dat ze zogenaamde STAP-cellen hebben kunnen genereren.

De controverse ontstond ongeveer 2 maanden geleden, toen stamcelwetenschapper Haruko Obokata plotseling een mediasensatie werd in Japan. De 30-jarige werd alom gevierd toen zij en collega's twee artikelen in Nature publiceerden waarin een nieuwe en verrassend eenvoudige manier werd beschreven om stamcellen te creëren, die de onderzoekers stimulus-triggered acquisitie van pluripotentie (STAP) cellen noemden.

Nu staat Obokata nog steeds in de schijnwerpers, maar het script is veranderd. Beweringen dat de kranten afbeeldingen bevatten die zijn gerecycled uit Obokata's Ph.D. dit proefschrift heeft onder andere twijfels over de claims aangewakkerd. En naarmate het onderzoek is gegroeid, hebben verschillende van de samenwerkende onderzoekers bevestigd dat ze ook nog geen STAP-cellen hebben geproduceerd.

Het zou niet ongebruikelijk zijn voor de hoofdauteur om het grootste deel van het werk voor de kranten uit te voeren, zegt Martin Pera, een stamcelwetenschapper aan de Universiteit van Melbourne in Australië. Maar gezien hoe revolutionair - en eenvoudig - de techniek moest zijn, zegt hij, "is de onzekerheid over reproduceerbaarheid raadselachtig."

Eerdere methoden voor het afleiden van pluripotente stamcellen, de universele cellen die werden gewaardeerd om hun mogelijke rol in regeneratieve geneeskunde, vereisten dat ze uit embryo's werden geëxtraheerd of dat volwassen cellen bepaalde genen tot overexpressie moesten brengen. Maar in een artikel en een brief online in Nature op 29 januari, beschreven Obokata en haar collega's van het RIKEN Center for Developmental Biology (RIKEN CDB) in Kobe, Japan, en bij andere instellingen in Japan en de Verenigde Staten een verbazingwekkend eenvoudig alternatief. Het enige dat nodig was om pluripotente stamcellen te maken, meldden ze, was het kort baden van bloedcellen van pasgeboren muizen in een mild zure oplossing en vervolgens het aanpassen van de kweekomstandigheden.

Binnen enkele dagen verschenen vragen over afbeeldingen in de twee kranten op blogs en de PubPeer-website. RIKEN CDB's in Tokio gevestigde moederorganisatie, RIKEN, startte op 13 februari een onderzoek. Nieuwe aantijgingen over deze en eerdere Obokata-kranten bleven voortkomen.

Op 14 maart kondigden de voorzitter van de onderzoekscommissie en andere RIKEN-functionarissen de tussentijdse resultaten aan tijdens een persconferentie die alleen in een ruimte was in Tokio. RIKEN-president en Nobelprijswinnaar Ryoji Noyori opende het evenement met een diepe buiging. "Mijn excuses voor de grote problemen en zorgen die zovelen in de samenleving hebben veroorzaakt door de STAP-artikelen die in Nature zijn gepubliceerd door RIKEN-onderzoekers, " zei hij.

De onderzoekscommissie concludeerde dat er voor twee van de onderzochte items sprake was geweest van "ongepaste verwerking van gegevens", maar volgens een persbericht van RIKEN volgens een RIKEN-persbericht "niet beoordeeld als wangedrag van het onderzoek". Maar de ambtenaren benadrukten dat zij afhankelijk zijn van de wetenschappelijke gemeenschap om uiteindelijk te beslissen of STAP-cellen kunnen worden afgeleid volgens de methode die Obokata en haar collega's beschreven hebben. "De missie van de onderzoekscommissie is om vast te stellen of er wangedrag is geweest; of STAP-cellen bestaan ​​is iets voor de wetenschappelijke gemeenschap om te bepalen, " zei commissievoorzitter Shunsuke Ishii, een moleculair geneticus van RIKEN, op de persconferentie, die duurde een marathon van 4 uur. Hij voegde eraan toe dat naar beste weten geen enkele externe groep succes heeft gemeld bij het genereren van STAP-cellen.

Onder de auteurs zegt alleen Charles Vacanti, een anesthesist en specialist op het gebied van weefseltechnologie in Brigham en Women's Hospital in Boston, dat zijn lab STAP-cellen kan maken. Obokata werkte enkele jaren onder Vacanti, beginnend in 2008, en ontwikkelde de STAP-techniek op basis van een deel van zijn eerdere werk. Een andere co-auteur, Teruhiko Wakayama, die in 2012 verhuisde van RIKEN CDB naar de Universiteit van Yamanashi, Kofu, bevestigde in een e-mail aan Science dat hij STAP-cellen had gemaakt terwijl hij samen met Obokata bij RIKEN werkte, maar niet in staat was om te reproduceren ze in zijn nieuwe lab.

Twee andere co-auteurs, Hitoshi Niwa en Yoshiki Sasai van RIKEN CDB, hadden niet geprobeerd de cellen onafhankelijk in hun labs te genereren voordat de kranten werden gepubliceerd. Im verward, zegt Hans Schler, een stamcel onderzoeker bij het Max Planck Instituut voor Moleculaire Biogeneeskunde in Mnster, Duitsland. Niwa en Sasai zijn hoog aangeschreven wetenschappers, zegt hij, en hun namen als auteurs leende de kranten een aanzienlijke geloofwaardigheid. RIKEN CDB-directeur Masatoshi Takeichi zei tijdens de persconferentie dat het laboratorium van Niwa nu werkt om de resultaten onafhankelijk van Obokata te reproduceren.

Wakayama's eigen twijfels zijn toegenomen. Een stamcelbioloog die bekend staat om werkklonenmuizen, hij zegt dat hij naar het team is gebracht om de chimere muizen te produceren die in het artikel worden beschreven. Hij gebruikte cellen van Obokata, zegt hij. "Ik wil geloven" in STAP-cellen, zegt Wakayama. Hij zegt echter dat de foto's die hem ervan hebben overtuigd dat de cellen echt waren, die zijn die nu worden verondersteld afkomstig te zijn van een compleet ander experiment dat is gerapporteerd in het proefschrift van Obokata. "Ik denk niet dat dit een simpele fout is", zegt Wakayama, en hij voegt eraan toe: "Ik weet niet meer in hoeverre het verhaal van Obokata waar is." Op 10 maart vroeg Wakayama om de papieren in te trekken, althans tijdelijk, totdat fouten zijn gecorrigeerd en de resultaten zijn bevestigd.

Tijdens de persconferentie zei Ishii dat de onderzoekscommissie twee van zes specifieke kwesties in de kranten had opgelost. Een problematisch beeld is een artefact van beeldcompressie en geen vervalsing of ongepast gedrag staat in het tussentijdse rapport. Maar de beweringen dat cijfers in het artikel werden gebruikt in Obokata's proefschrift lijken op doel te liggen. Obokata en een van haar co-auteurs vertelden de commissie dat deze cijfers per ongeluk werden gebruikt. Ishii benadrukte dat deze kwestie nog steeds wordt onderzocht en dat eventuele beoordelingen over wangedrag na nader beraad zullen komen.

In een schriftelijke verklaring die aan de pers werd vrijgegeven, verontschuldigden Obokata, Niwa en Sasai zich voor de verwarring als gevolg van de onzekerheden en onnauwkeurigheden in de kranten en schreven: We nemen contact op met andere co-auteurs over de mogelijkheid deze in te trekken.

Vacanti is terughoudend. "Bij gebrek aan overtuigend bewijs dat de gepresenteerde gegevens onjuist zijn, geloof ik niet dat de manuscripten moeten worden ingetrokken, " schreef hij in een verklaring.

Een woordvoerder van Nature vertelde Science per e-mail dat het eigen onderzoek van het tijdschrift nog steeds aan de gang is. Niet alle auteurs zouden noodzakelijkerwijs moeten instemmen met een intrekking, schreef de woordvoerder.

De Nature- kranten zijn niet de enige Obokata-publicaties die onder vuur liggen. Beschuldigingen kwamen vorige week naar voren dat grote delen van een hoofdstuk van haar proefschrift, ingediend bij Waseda University in 2011, lijken te zijn gekopieerd van een website van de National Institutes of Health en dat voetnoten naar andere hoofdstukken werden gekopieerd en geplakt uit andere publicaties. Lokale media hebben gemeld dat Obokata zei dat ze van plan is om het proefschrift in te trekken. Een PR-functionaris van Waseda bevestigde dat een faculteitslid zo'n e-mail had ontvangen, maar zei dat de universiteit die onderzoek doet geen formeel verzoek van Obokata heeft ontvangen. Als het proefschrift wordt ingetrokken, verliest Obokata haar doctoraat.

De schittering van de schijnwerper is niet altijd comfortabel.

* Correctie, 19 maart, 10:12 uur: dit item is gecorrigeerd. Een eerdere versie verklaarde ten onrechte dat zes laboratoria bij de kranten waren betrokken, maar er waren er nog meerdere die bijdroegen aan het gepubliceerde werk.