Hoe een laboratoriumnotitieboekje te bewaren

Cultura Creative (RF) / Alamy Stock Photo

Hoe een laboratoriumnotitieboekje te bewaren

Door Elisabeth PainSep. 3, 2019, 13:45 uur

Waar heb ik dat papiertje neergelegd? Wanneer heb ik dat experiment gedaan? Waar heb ik dat gegevensbestand opgeslagen? Als u vaak merkt dat u op zoek bent naar kritieke informatie die u hebt genoteerd tijdens het uitvoeren van uw experiment, probeerde te onthouden wanneer u wat deed of uw harde schijf doorzocht om het juiste bestand te vinden, is het misschien tijd om opnieuw te kijken hoe u uw onderzoeksnotities. Of u nu aan de bank, in het veld of in theorie werkt, u moet bijhouden wat u doet, zodat u en anderen er naar terug kunnen verwijzen wanneer dat nodig is.

Er zijn meerdere tools beschikbaar naast het traditionele papieren notitieboek om wetenschappers te helpen hun werk en voortgang te documenteren, maar het is zelden geleerd om een ​​goed notitieboek te bewaren. Veel onderzoeksinstellingen, financieringsinstellingen en beroepsverenigingen hebben eisen of bieden richtlijnen. Maar afgezien van ervoor te zorgen dat je geen regels overtreedt, is er vaak ruimte voor creativiteit en persoonlijke voorkeur mits het notuleren effectief is. Science Careers vroeg onderzoekers uit verschillende disciplines en carrièrestadia om de tips en strategieën te delen die voor hen werken. Hun antwoorden zijn bewerkt voor duidelijkheid en beknoptheid.

Het bijhouden van een onderzoeksnotitieboekje wordt vaak gezien als een karwei. Waarom is het belangrijk om er voldoende tijd en moeite aan te besteden?

Lab-notitieboekjes zijn alsof je naar de tandarts gaat. Niemand vindt het leuk, maar als je het niet doet, vallen al je tanden eruit. Lab-notebooks zijn de meest nuttige bron die u voor uzelf in het lab kunt maken, en het maken van een goede vereist elke dag een beetje inspanning. Als je eenmaal aan de gewoonte gewend bent en een systeem hebt dat je leuk vindt, wordt het minder belastend.
- Caroline Bartman , postdoctoraal fellow in kwantitatieve metabolomics aan de Princeton University

Mijn lab-notebook houdt al mijn onderzoeksexperimenten en al mijn fouten en optimalisaties bij. Itsa geweldig hulpmiddel voor het handhaven van discipline en reproducibilityif ik niet meer weet hoe ik het deed een experiment of hoe ik de gegevens geanalyseerd, al die informatie is in mijn notebook. Het maakt het ook zoveel gemakkelijker voor je toekomstige laboratoriumgenoten die mogelijk een soortgelijk experiment moeten uitvoeren en willen zien wat je al hebt geprobeerd.
- Maiko Kitaoka , Ph.D. kandidaat in moleculaire en celbiologie aan de Universiteit van Californië, Berkeley

Het hebben van een zorgvuldig verslag van mijn experimentele stappen hielp me bepaalde resultaten te begrijpen. Als u vaststelt wat er op een specifieke dag is gebeurd, kunt u een indicatie krijgen of bepaalde gegevens uitschieters zijn vanwege omgevingsfactoren, zoals een temperatuurverandering. In de loop van de tijd is mijn lab-notebook ook geëvolueerd naar een hulpmiddel om mijn ideeën bij te houden. Misschien wilt u uw ontwerp of methode niet midden in een experiment wijzigen, maar uw notebook is de perfecte plek om te noteren wat u vervolgens wilt proberen.
- Valentina Ferro , Ph.D.-houder van illustrator van experimentele fysica en freelance wetenschap in Seattle, Washington

Gerelateerde inhoud

  • student werkt in de bibliotheek

    Hoe schrijf je je Ph.D. scriptie

  • oude bibliotheek

    Hoe de wetenschappelijke literatuur bij te houden

Lees meer How-Tos

In een theoretisch veld als het mijne is een notebook essentieel om mijn pogingen om een ​​probleem op te lossen bij te houden. Zonder goed geschreven aantekeningen zou ik waarschijnlijk vaak dezelfde berekeningen uitvoeren. Een notebook is ook handig om mijn benaderingen en resultaten met medewerkers te delen.
- Matteo Falessi , postdoctoraal onderzoeker in plasmafysica bij het ENEA Frascati Research Center in Italië

Terugkomen op oude gegevens zonder sterke documentatie kan een beetje lijken op een archeologische expeditie. Een goed notitieboek maakt het mogelijk om snel te zien welke experimenten werden gedaan en met welk doel, oude gegevens opnieuw evalueren in het licht van nieuwe bevindingen en het werk waar u het had achtergelaten, weer op te pakken. Meer in het algemeen, goede noten maken reproduceerbaarheid van onderzoek mogelijk; schriftelijk bewijs leveren dat alles op een duidelijke, transparante en ethische manier is gedaan; en motiveren waarom bepaalde onderzoekskeuzes zijn gemaakt.
- Caroline Lynn Kamerlin , hoogleraar structurele biologie aan de Universiteit van Uppsala in Zweden

Als u maanden of zelfs jaren na het voltooien van experimenten een paper schrijft, bevat uw laboratoriumnotitieboekje alle details die u nodig hebt om uw methoden en resultaten nauwkeurig te beschrijven. Op een bepaald punt in je carrière moet je het misschien ook gebruiken om aan te tonen dat een idee echt "van jou" was of om aanspraak te maken op je intellectuele eigendom. Bovendien is uw laboratoriumnotitieboekje in het geval van wetenschappelijke wangedrag beschuldigingen een onmisbaar element in het onderzoek. Uiteindelijk zal het lab-notebook fungeren als het grootboek van je carrière en onderdeel worden van je nalatenschap als wetenschapper. Verwaarloos het niet!
- Jeremy C. Borniger , postdoctorale fellow in neurowetenschappen aan de Stanford University in Palo Alto, Californië

Gebruik je een traditioneel papieren notitieboek, digitale hulpmiddelen of een combinatie?

Ik gebruik graag een handgeschreven notebook, hoewel de meeste gegevens die ik produceer digitaal zijn. Ik neem ook af en toe technische details op - zoals specifieke acquisitie-instellingen op microscopen of welke experimenten ik samenvoegde om een ​​figuur te maken - in tekstbestanden waar ik ze het gemakkelijkst kan vinden. Een uitdaging met een traditioneel papieren notitieboek is echter dat het niet altijd gemakkelijk kan worden doorzocht, dus gebruik ik de eerste paar pagina's om een ​​inhoudsopgave bij te houden en verwijs ik zo vaak mogelijk naar mijn digitale gegevensbestanden.
- Kitaoka

Ik vind een elektronisch lab-notebook zo veel beter dan een papieren. Het is doorzoekbaar, dus ik kan gemakkelijk records van experimenten ophalen die ik jaren geleden heb gedaan of er doorheen bladeren om belangrijke details te vinden. Ik zal het nooit vernietigen door per ongeluk een beker ethanol om te gooien. En zolang je er een back-up van maakt, is het onmogelijk om te verliezen. Bovendien moet ik het zonder handschoenen aan mijn bureau invullen, wat me dwingt om er wat tijd voor te maken.
- Bartman

Ik gebruik een papieren notitieboekje sinds het begin van mijn onderzoekscarrière, maar in de loop van de tijd moest ik mijn strategie aanpassen omdat ik op al die pagina's verdwaald was. Tegenwoordig gebruik ik mijn lab-notebook alleen om snel notities te maken terwijl ik ga. Al mijn geoptimaliseerde protocollen, onbewerkte gegevens en analyses worden op de computer opgeslagen. Ik verwijs naar mijn aantekeningen en computerbestanden met behulp van de datum en een korte beschrijving van elk experiment. Daarnaast vind ik het handig om een ​​apart onderzoeksnotitieboekje bij te houden voor bredere kwesties zoals het opstellen van een experiment, het opstellen van een manuscript, het organiseren van een vergadering of het maken van aantekeningen tijdens een conferentie.
- Karine Salin , vaste onderzoeker in omgevingsfysiologie aan IFREMER in Plouzané, Frankrijk

Ik krijg meer ideeën op papier, dus in eerste instantie wilde ik koste wat kost een traditionele laptop hebben. Maar ik werkte aan verschillende projecten en ik moest mijn notitieblok doorzoekbaar en tagbaar maken om gemakkelijker bij te houden. Het mooie voor mij was het gebruik van een digitaal notitieboek zoals Evernote met de mogelijkheid om snapshots van traditionele pen- en papieren notities op te nemen, evenals de coderingsscripts en andere digitale bestanden en afbeeldingen die ik heb gegenereerd. Bovendien had de app op mijn telefoon als gevolg dat ik tijdens het lopen spraaknotities kon opnemen als ik een idee kreeg dat ik later wilde proberen. Met een digitaal notitieboek is het echter bijna onmogelijk om dingen te vinden die u bent vergeten zoals u zou doen door gewoon door de pagina's van uw papieren notitieboek te bladeren. Ik overwon het probleem door iets wat minder relevant was voor de experimenten te taggen - bijvoorbeeld niet-verwante ideeën en verdere vragen om na te streven - met de tag 'willekeurig' zodat ik ze zo nu en dan kon doorbladeren op zoek naar inspiratie.
- Ferro

Voor het grootste deel van mijn werk volstaat een papieren notitieboek. Ik zorg er echter voor dat ik een digitale back-up van alle notities maak door een foto te maken met de Genius Scan-app of ze op te schrijven in Microsoft Word. Ik heb ook een computermap waar ik al mijn standaardprotocollen opsla zodat ik er gewoon naar kan verwijzen in plaats van het hele ding in mijn notitieboekje te schrijven telkens als ik een experiment doe. Bovendien heb ik afzonderlijke gelabelde binders voor elke lijn van werk waar ik notities en gegevens plaats die niet gemakkelijk in de notebook passen, zoals Microsoft Excel-afdrukken, grafische gegevens, contracten en materiaaloverdrachtsovereenkomsten.
- Borniger

Ik schrijf mijn digitale notebook in de Org-modus, een opmaaktaal die speciaal is ontworpen om gemakkelijk handgeschreven afbeeldingen zoals resultaten, berekeningen, vergelijkingen, tabellen, bibliografieën en zelfs stukjes code in te voegen. De notebook zelf bestaat uit verschillende gekoppelde platte tekstbestanden, dus als ik een papier heb om te schrijven, kan ik de tekstbestanden gemakkelijk als concepten gebruiken door ze naar een LaTeX-bestand te exporteren.
- Falessi

Ik gebruik voornamelijk een elektronisch notitieboek, maar vaak schrijf ik mijn aantekeningen in het laboratorium eerst in een papieren notitieboek - nooit een stuk papier - en scan ik vervolgens ook mijn papieren notitieboek zodat ik altijd toegang heb tot de inhoud. Ik gebruik Confluence voor het elektronische record, maar Microsoft OneNote is een andere goede optie omdat u het offline en online kunt gebruiken en het is gratis. Ik kruisverwijzing met behulp van paginanummers uit mijn papieren notitieblok en datums en namen van de experimenten in mijn bestandsnamen. Al mijn protocollen bevinden zich in mijn digitale notebook - vaak met foto's van mijn experimentele opstellingen, materiaal, apparatuur en soms een video-opname van mij die elke stap van het protocol doorneemt. Ik bewaar mijn onbewerkte gegevens op de server van mijn lab en maak een back-up op de cloud en op een harde schijf. Mijn code voor het verwerken en analyseren van gegevens is op Github, een populair softwareversiesysteem. Tot slot bewaar ik een takenlijst in mijn elektronische notitieboek, die ook dient als een overzicht van wat ik elke week heb bereikt.
- Lina Colucci , onderzoeksfiliaal in gezondheidswetenschappen en technologie aan het Massachusetts Institute of Technology in Cambridge en data science consulting ondernemer in de San Francisco Bay Area

Welke strategieën gebruikt u om uw notebook georganiseerd, compleet en in overeenstemming met best practices te houden?

Wat voor mij werkt, is noteren als een essentiële experimentele stap beschouwen. Ik schrijf meestal dingen op terwijl ik verder ga, soms schrijf ik het protocol op of wat ik ga doen voordat ik aan het experiment begin en bewerk dan alles wat ik anders deed dan gepland. Op deze manier is het bijhouden van een laboratoriumnotitieboekje vergelijkbaar met koken, waarbij opruimen gedurende het hele proces het een stuk eenvoudiger maakt dan wachten tot het einde wanneer gerechten naar het plafond worden gestapeld. Het zo snel mogelijk invullen van het lab-notebook verkleint ook de kans op het vergeten van essentiële informatie of het introduceren van een fout.

In termen van hoe mijn papieren notitieboek is georganiseerd, volg ik eenvoudig de chronologische volgorde, dus elke pagina is een nieuwe dag (tenzij ik meerdere pagina's op een dag gebruik). Ik zorg ervoor dat ik een gedetailleerde beschrijving geef van wat ik deed, waarom en hoe in de tegenwoordige tijd; de datum, tijd en locatie waarop het werk is gedaan; de namen van anderen met wie ik het werk heb gedaan; speciale omstandigheden die zich tijdens het werk hebben voorgedaan (was er bijvoorbeeld een brandalarm dat de resultaten had kunnen beïnvloeden?); en mijn handtekening en, waar mogelijk, een getuigenis (meestal mijn hoofdonderzoeker of een laboratoriummaatje). Dit alles moet in een pen worden geschreven, en als er iets fout was, kruis het dan niet helemaal door; zet er gewoon een enkele regel doorheen zodat het nog steeds kan worden gelezen. Het opschrijven van ideeën (in plaats van methodologie) is ook acceptabel en wordt aangemoedigd.
- Borniger

In mijn papieren notitieboek is elk experiment een cluster van opeenvolgende pagina's, omdat het voor mij te moeilijk werd om individuele experimenten te volgen als ze met andere werden gemengd. Als ik meerdere experimenten tegelijk doe, laat ik lege ruimte tussen mijn records voor hen zodat al mijn aantekeningen en protocollen met betrekking tot een individueel experiment continu zijn, zelfs voor experimenten met meerdere dagen. Details maken of breken de notebook echt, dus ik probeer beknopt te zijn terwijl ik zoveel mogelijk relevante details opneem.
- Kitaoka

Ik vertel mijn studenten dat ze geen specifiek formaat in hun papieren notitieblok hoeven te volgen, zolang de informatie er maar is en gemakkelijk te vinden is. Ik laat ze opschrijven wat ze kunnen voordat ze aan het experiment beginnen. Ik geef ze ook de instructie om de procedure vast te leggen terwijl ze verdergaan, omdat ze vaak per ongeluk stappen missen of buiten gebruik zijn, en dat is belangrijk om op te nemen. Hun eerste experimenten zullen waarschijnlijk veel details vereisen over hoe de procedure moet worden opgezet en uitgevoerd terwijl ze, eenmaal ervaren, alleen de relevante variabelen hoeven op te merken. Ze mogen nooit afzonderlijke notities opnemen om later te kopiëren, omdat dit onvermijdelijk tot verloren informatie leidt.
- Danielle Solano , universitair hoofddocent en voorzitter van het Departement Chemie en Biochemie aan de California State University in Bakersfield

Een van de moeilijkste dingen bij het onderhouden van een laboratoriumnotitieboekje is het beslissen wanneer u een grondige invoer schrijft en wanneer u een vluchtige invoer schrijft. Ik begin altijd met het schrijven van een minimale hoeveelheid informatie voor elk experiment. Dit omvat over het algemeen datum, tijd, locatie, protocolparameters, waar de gegevens worden opgeslagen, en als ik met code de scriptnaam en Github-codeversie gebruik. Zodra ik me realiseer dat een bepaald experiment geen doodlopende weg is, schrijf ik een langer rapport waarin het doel van het experiment wordt beschreven; hypothese; datum (data) van gegevensverzameling; links naar de gegevens, analysescripts, notities gemaakt op de dag van gegevensverzameling en het volledige protocol; foto's of video's van de experimentele opstelling; resultaten; conclusies; en ten slotte de volgende stappen.

Ik houd de dingen in chronologische volgorde en dateer elke pagina van mijn papieren notitieboek en ik plaats vaak de locatie waar ik het experiment heb gedaan of mijn aantekeningen heb geschreven. Als ik iets in het notitieboekje plak, teken ik en dateer ik over de band. Als ik terugga en iets op een oude pagina verander, teken en dateer ik de wijziging. Voor mijn elektronische notebook plan ik geautomatiseerde dagelijkse back-ups.
- Colucci

Bij het starten van mijn eerste experiment van de dag, zou ik een notitie maken op Evernote met de datum en daar aan toevoegen terwijl ik foto's maakte van mijn pen- en papieren notities in het lab en later extra notities organiseerde in de app. Aan het einde van elke dag had ik 15 minuten nodig om mijn invoer te lezen en alles wat onduidelijk was omdat ik het te snel opschreef, extra afbeeldingen of analyses te uploaden en enkele laatste gedachten toe te voegen. Ik zou afsluiten door de juiste tagging toe te voegen.
- Ferro

Mijn notebook heeft twee overkoepelende secties: een voor de verfijnde protocollen die ik heb samengesteld na een paar keer een nieuw experiment te hebben uitgevoerd en de andere voor mijn experimentrecords. Voor dat tweede deel noteer ik notities en observaties op kladpapier terwijl ik experimenten uitvoer en informatie later in mijn e-notebook op een meer georganiseerde manier invoer. Het kan super vervelend zijn om je lab-notebook in te vullen na een vermoeiend en complex experiment, maar dat is misschien wel de meest kritieke tijd! Voor die dagen dat ik het echt moet uitstellen, bewaar ik een gedeelte van mijn bureau voor experimentele notities, die ik vervolgens kan gebruiken om mijn notebook de volgende dag bij te werken.
- Bartman

Verder advies?

Ik raad ten zeerste aan om het begin van iemands onderzoekservaring te gebruiken als een proefperiode voor lab-notebookmethoden om een ​​aanpak te vinden die voor u werkt. De belangrijkste criteria zijn dat het eenvoudig en gemakkelijk te gebruiken en gemakkelijk te backuppen is. Dat gezegd hebbende, geen enkele methode is perfect, dus beperk je tot drie of vier tools. Ik heb geleerd dat het nadeel van het experimenteren met een heleboel verschillende tools is dat je gegevens verspreid zijn over notebooks, wat het erg uitdagend kan maken om te vinden wat je zoekt.
- Colucci

Afgezien van vallen en opstaan, leerde ik wat er in mijn aantekeningen moest worden opgenomen door notitieboekjes van voormalige lableden te lezen en uit te zoeken wat een experiment gemakkelijker of moeilijker te reproduceren maakte in de beschrijving. Een gebrek aan informatie kan erg frustrerend zijn en ik wil elke follow-up van mijn experimenten zo soepel mogelijk maken.
- Kitaoka

Op voorwaarde dat u geen regels overtreedt, wees niet bang om uw eigen manier om aantekeningen te maken te ontwikkelen. Een van de instellingen die ik bezocht had zijn eigen richtlijnen, maar omdat mijn individuele aanpak voor mij werkte, besloot ik ermee door te gaan en mijn werk een keer per week te vertalen naar een compatibel notitieboek. Het lijkt misschien extra werk, maar voor mij was het ofwel doen of riskeren dat ik zou stoppen met het consequent gebruiken van mijn lab-notebook, wat een groter verlies voor mij, mijn lab en zelfs voor de instelling zou zijn geweest.

Het lijkt misschien eerst een hele klus, maar het bijhouden van wat je doet kan een geweldige bui zijn. Een onderzoeksproject bestaat uit veel experimentele ups en downs, maar meestal downs, dus een beetje blauw en nutteloos voelen is heel gebruikelijk. Terugkijkend op uw notebook kunt u dingen relativeren en beseffen hoeveel u daadwerkelijk bereikt.
- Ferro

Het is zo gemakkelijk voor het bewaren van aantekeningen in een laboratorium als iets dat schijnbaar van ondergeschikt belang is om de experimenten gedaan te krijgen, maar het is zo belangrijk voor archiverings- en referentiedoeleinden. Het is nooit te laat om goede gewoonten te beginnen, dus denk er eens goed over na hoe je je aantekeningen bewaart - en als je een upgrade nodig hebt, begin het dan vandaag nog in je routine te implementeren!
- Kamerlin